肛瘺臨床具有一定復發率，尤其是復發率較高的高位復雜性肛瘺，目前仍是肛腸科醫生重點關注的和研究的方向之一。肛瘺的發病從很大程度上跟飲食、不良生活習慣密切相關，如經常過食辛辣刺激食物、長期飲酒等都是肛瘺重要的發病因素。手術后必須十分重視飲食，忌食辛辣、刺激、油膩的食物，忌飲酒等不良的生活習慣。其次，肛腸疾病術后換藥也特別重要，尤其對復雜性肛瘺的換藥非常關鍵，如果換藥不徹底，沒有定期復診和隨訪，切口容易出現假性愈合而導致復發。另外一個重要的因素是手術前的誤診，包括畸胎瘤、骶前囊腫等疾病，臨床上可能會診斷為復雜性肛瘺，這樣的疾病手術之后復發率相對較高，所以術前評估非常重要。手術醫生的經驗對患者是否復發也非常重要，手術過程中如遺漏了肛瘺的瘺管，肛瘺的內口定位不準確，也是肛瘺復發的重要因素。建議患者到正規醫院肛腸專科就診。