長期服用乳果糖治療便秘，長期應該是相對概念，與蘆薈、聚乙二醇，或者其他比如中藥含有大黃類的治療便秘藥物相比，長期服用乳果糖安全。因為乳果糖本身是高分子化合物，亦是益生元，進入腸道里不被腸黏膜所吸收，不會進入到血液循環中對其他臟器帶來不利影響，益生元有助于腸道益生菌增殖、生長，可以調節腸道微生態環境，亦可以促進益生菌增殖以后對腸道健康帶來好處。所以乳果糖如果長期服用，治療便秘沒有較大影響。乳果糖本身是益生元，幫助調節腸道微生態環境時，可以促進腸道內小分子的酸性物質生成，比如乙酸、丙酸、丁酸等，在一定時間內對腸道微生態調節有好處。但如果腸道長期處于酸性環境，可能導致另外一種層面的腸道微生態改變，導致人體出現不明確的異常。無論乳果糖能否進入到血液循環當中，如果長期存在微生態影響，可能會對身體帶來潛在影響，所以任何一種藥物均不適合長期服用，除非不得不使用。