嚴重腸胃炎患者可能表現為上吐下瀉，嚴重時可能出現脫水，因經胃腸道丟失液體較明顯，嚴重脫水也可能并發嚴重感染，如果未進行積極治療，胃腸炎可能造成感染性休克，甚至危及生命。大部分急性腸胃炎病程較短，經過積極對癥、對因支持治療后，短時間內均可恢復正常。但如果急性胃腸炎并未在短時間內較好控制癥狀，并發嚴重感染且由于胃腸道失水嚴重，導致明顯脫水等，此時可造成嚴重后果，可導致嚴重發癥出現。出現急性胃腸炎時，給予積極對因和對癥支持治療較重要，如果合并細菌感染時，需選用合適抗生素，如針對消化道感染，可選用喹諾酮類、頭孢類抗生素。還需針對上吐下瀉癥狀進行積極對癥治療，如充分補液，避免補液不充足。此外，還可以應用黏膜保護劑、止瀉藥物緩解癥狀。