缺碘造成的最嚴重損害，是影響胎兒和嬰幼兒的腦發育、體格發育，嚴重時可以導致死亡。嚴重的碘缺乏，胎兒幾乎不能存活，可以表現為死胎、流產、先天畸形或出生以后嬰幼兒的死亡率升高。如果嬰幼兒能夠存活下來，可以表現為地方性的克汀病，也稱為呆小病。這種病通常可以表現為癡呆、痙攣性癱瘓、步態異常、共濟失調、斜視。嚴重的甲狀腺功能異常患兒，還可以出現黏液性水腫。通常這些患兒發育落后、智商比較低、不能上學、生活難以自理，給家庭以及社會帶來重大的負擔。輕度的碘缺乏，這些患兒通常大體發育正常，與正常兒童沒有明顯區別，但是可以表現在入學以后學習能力差。部分患兒還可以表現為精神和運動功能異常、動作準確性比較差、完成精細動作困難、智商處于輕度智力落后、很難完成小學學業。