巧克力囊腫也分很多種，囊腫很大，已經超過了10cm，或者巧克力囊腫時間很長，做B超或者CT，發現囊腫的內壁已經形成了新生的乳頭，這種就有可能為巧克力囊腫惡變，必須及時做手術治療。此外，巧克力囊腫要查CA125，如果CA125突然間從50-60U/ml升到500-600U/ml，這種情況也要及時做手術。 但是，如果現在是巧克力囊腫的初期，囊腫僅僅是3cm，不到5cm，也沒有任何的癥狀，但是B超就確定是巧克力囊腫，而且腫瘤標志物CA125也升高，比如說30-40U/ml，這種巧克力囊腫自愈的最好的辦法就是懷孕。育齡期女性正常的懷孕，經過懷孕期和哺乳期，給予卵巢休息，體內的雌激素很低，不刺激巧克力囊腫的進展，內膜細胞逐漸消亡。所以懷孕是特別好的辦法。另外，要注意控制脾氣，因為這個病就是內分泌失調的病，當內分泌調整好，比如積極鍛煉，給自己減壓，這個病就不會繼續進展，甚至會有緩解。