巧克力囊腫有嚴重和不嚴重的，具體分析如下：1、不嚴重：如果是很輕微的巧克力囊腫，在不影響懷孕，又沒有不舒服的情況下，不需要特殊治療，因為不會影響正常生活，可能跟人工流產、痛經有關；2、嚴重：如果巧克力囊腫導致痛經很厲害，則比較嚴重，還可能會影響懷孕，引起不孕癥，通常年輕時痛經，在進行生育與哺乳后可緩解，但是如今較多30多歲女性仍然未婚，痛經時間較長，從而導致炎癥積累，使卵巢囊腫增大或嚴重粘連，可能影響生育、正常生活狀態及性生活滿意度。這種情況需及時進行治療，治療之后還要好好保護，懷孕、哺乳、再懷孕、再哺乳，對于巧克力囊腫是一個最好的治療方法。