原發性肝癌最有價值的定性檢查是甲胎蛋白。當甲胎蛋白顯著性升高后，需要高度懷疑出現肝癌，另外，影像學的定位檢查，如CT或磁共振發現肝臟出現新生結節，再結合甲胎蛋白升高，基本可以在臨床上診斷為原發性肝癌。而在體檢篩查過程中，需要特別注意對于高危人群的篩查，包括年齡超過40歲的患者、長期感染乙肝病毒的患者以及長期飲酒、酗酒等存在不良生活習慣的患者。