肛瘺手術的恢復標準最后為完全治愈。肛門會有瘢痕，因為肛瘺切開以后會遺留瘢痕，但是低位的很淺，高位瘢痕重些，但是最后都會慢慢軟化形成一條線。用虛實結合掛線法來治療肛瘺，瘢痕是非常小的。 完全治愈的標準，比如之前流膿水現在沒有膿水了，下墜的、疼痛的、難受的、發燒的、腫的等所有的癥狀完全消失，大便也沒有血，這時基本上就可判斷肛瘺徹底治愈。當然最后創口的瘢痕軟化需要三個月到半年的時間，瘢痕還會較硬，有時會出現針扎樣疼痛，偶爾會有。 所以肛瘺痊愈的癥狀非常簡單，即癥狀完全消失，只是偶爾會有針扎樣疼痛，或者肛門中有些分泌物，稍微很少的腸液流出，這些都是正常情況。瘢痕不可能完全閉合，需半年后才能閉合的非常好。