肛瘺一旦確診，唯一的辦法是通過手術治療。肛門里面大約1.5cm左右的腸壁上的一個腺體，稱為肛竇，肛竇感染導致肛周膿腫。膿腫破潰或者炎癥消退一些之后會形成管道，稱之為肛瘺。臨床常見表現是肛門外有一個小孔，它在流膿，稱之為外口。但是疾病的根源在于肛門里面腸壁上感染的腺體，一旦感染，相當于腸壁上有一個小洞，如果里面的小洞，即內口不處理，肛瘺會反復發作。目前任何的藥物都無法讓內口自行的愈合，所以一旦確診是肛瘺，都需要到正規的肛腸專科進行檢查，通過手術進行治療。