益生菌對幽門螺桿菌并無特別的效果，即服用益生菌不會殺滅幽門螺桿菌。幽門螺桿菌是定植在胃內的細菌，與多種消化系統疾病有關，比如慢性胃炎、胃潰瘍、十二指腸潰瘍、胃癌、胃MALT淋巴瘤等。 益生菌通常是指腸道益生菌，常用的包括地衣芽孢桿菌、枯草桿菌、雙歧桿菌、嗜酸乳桿菌等，有利于維持腸道正常環境，與腸道相關疾病存在一定相關性。 針對幽門螺桿菌的根除，臨床多選擇標準的四聯療法，即4種藥物聯合使用，包括1種質子泵抑制劑、2種抗生素、1種鉍劑。 質子泵抑制劑包括雷貝拉唑、泮托拉唑、奧美拉唑等。抗生素包括阿莫西林、克拉霉素、左氧氟沙星、甲硝唑、四環素、呋喃唑酮等。