急性腸胃炎患者住院的時間，取決于感染的微生物類型。若為常見的大腸埃希菌、金黃色葡萄球菌等引起的急性胃腸炎，雖然發病率高，但病程較短，經過有效治療后可以迅速緩解癥狀，通常1-3天即可出院。而沙門氏菌引起的食物中毒，其中毒癥狀較重，會出現腹痛、腹瀉、惡心、嘔吐 、高熱甚至膿毒血癥表現，有時住院時間高達7-14天。所以根據不同類型的微生物引起的急性胃腸炎，住院時間和治療周期也不同。急性胃腸炎的治療，先要囑咐患者改變進食方式，給予流質飲食或半流質飲食，再逐漸轉為清淡飲食。嘔吐為急性胃腸炎常見癥狀之一，要給予患者有效的止吐治療，臨床上可以使用甲氧氯普胺、中樞性止吐劑或B族維生素進行止吐治療。若患者出現明顯腹痛，可考慮給予解痙藥物進行止痛治療，臨床常用的如山莨菪堿等。根據引起急性胃腸炎的病原微生物種類，會給予相應的抗感染治療，通常選用喹諾酮類和氨基糖苷類藥物進行治療。