一般的口腔潰瘍不主張大家吃止疼藥，主要以口腔局部麻醉藥止疼。若潰瘍較少且影響進食，可在進食前局部涂抹利多卡因凝膠等有止疼作用的局麻藥物。如果潰瘍較多且大多是皰疹樣的阿弗他潰瘍，可以用止疼藥、麻醉藥，配成漱口水讓患者含漱進而起到止疼作用。因為口腔潰瘍病損部位明確，所以局部涂抹可達到止疼作用。口腔潰瘍的疼痛不是自發性疼痛，一般不選用口服止疼藥。平時只會有輕微疼痛且多數在進食時疼痛，進而在潰瘍部位涂抹一些麻醉劑后再進食，如奧布卡因凝膠等。若疼痛特別嚴重，可能是潰瘍或疾病，如壞死性潰瘍，需要到醫院明確診斷后再選擇用藥。