空腹飲用酸奶可能會導致胃酸分泌增多，人體會出現胃黏膜充血、水腫、糜爛等情況，不提倡空腹飲用酸奶。通常進餐后0.5個小時飲用酸奶較適宜，而茶、咖啡等餐前或者空腹服用，胃酸分泌增多時會導致胃黏膜充血、水腫，進而出現腹脹、噯氣、反酸等消化道癥狀。此外，對于益生菌藥物常建議餐后服用，如雙歧桿菌、乳酸桿菌、酪酸梭菌、布拉氏酵母菌、枯草桿菌等，均建議餐后0.5個小時服用。若空腹服用時可導致胃酸分泌增多，益生菌酸性環境中易被破壞，可能會降低藥效而無法達到理想效果。