化膿性腦炎和病毒性腦炎，后遺癥有共性。化膿性腦炎治療時間過久，或感染癥狀過重，沒有得到很好治療時，腦細胞發生不可逆損害，就會引起后遺癥，比如癲癇、智能障礙、精神癥狀，包括偏癱、腦積水都是該病后遺癥。預防后遺癥，懷疑患有腦炎病人要盡早到醫院就診，到正規醫院治療，能及時行腰穿及頭顱磁共振影像學檢查，找到病原學，及時給予對癥處理，處理及時可能防止感染后遺癥。