膽總管囊腫屬于先天性疾病，如果不及時治療，有可能會出現膽管癌嚴重的并發癥。膽總管囊腫現在采用的手術方式主要是膽總管囊腫的完整切除以及膽管空腸重新吻合。這種手術方式保證了能夠盡量的把膽總管有病變的成分完整的切除，同時膽管空腸重新建立吻合，以保證肝臟合成的膽汁能夠重新進入到腸道，成功的手術可以把膽總管囊腫徹底的治愈。對于囊腫比較大，囊腫已經深入到胰腺，累及了肝臟，有可能會做連同肝部分切除，這種手術還存在著一定的風險。為了避免手術當中出現額外的副損傷，特別是對胰腺的損傷，會保留一部分的膽管，其中也有可能會保留一部分囊腫壁，手術后需要定期的觀察，定期的CT等影像學檢查，以發現殘留的一部分囊腫是否依然有發生癌變的風險。