凌晨3點鐘醒的原因如下：一、生理原因：隨著年紀增長，如50歲左右，后半夜容易醒，晚上大段的睡眠消失，屬于正常生理現象。如果醒過來上廁所或者看書、手機后能入睡，早上醒過來時，精神狀態飽滿，工作、學習、生活不受影響；二、病理原因：1、男性患者到50歲左右可能會出現前列腺增生，后半夜總是起夜。2、抑郁癥、抑郁狀態會導致早醒，這種情況會合并心煩、氣急、緊張、擔心、害怕的情況，患者情緒低落、消極沮喪。