高位復雜性肛瘺被稱為肛腸科難治性疾病，易復發，其內口、外口竇道較多，不易全部檢測到，檢查目的主要為尋找內口、外口竇道。檢查方法較多，如CT、核磁共振、竇道造影等，探針亦為常用方法，手術在麻醉狀態下進行，可用探針直接探查，通過一個外口尋找竇道位置。探查時需要小心細致，才可正確找到內口，準確處理、避免復發。