卵巢巧克力囊腫的外形如巧克力樣，指的是子宮內膜異位囊腫。子宮兩側各有一個卵巢，當子宮內膜長在宮腔內，順著輸卵管異位到卵巢部位時會來月經，屬于有活性的內膜，周圍形成纖維素包裹，形成血包，有形成分被吸收后，剩下的含鐵血黃素變成陳舊血，顏色如巧克力色，所以稱為巧克力囊腫。長在卵巢部位的子宮內膜異位囊腫較常見，可以一側長幾個或者每側都有，還可以異位到盆腔腹膜上。巧克力囊腫在臨床上需要手術治療，因為囊腫會逐漸侵蝕正常卵巢，如果不處理會越長越大，甚至破裂在盆腔內，如果囊腫時間較長，如10-20年部分患者會表現為囊腫惡變，所以巧克力囊腫需要手術治療。