卵巢巧克力囊腫即異位的子宮內膜生長于卵巢內，而正常子宮內膜應該位于宮腔內。子宮內膜異位生長于卵巢內，可引起月經時出血，逐漸形成囊腫，稱為卵巢巧克力囊腫，屬于子宮內膜異位癥中最為常見的一種類型。 之所以稱之為卵巢巧克力囊腫，因為將卵巢子宮內膜異位囊腫切開后，內部存在大量巧克力樣液體，百姓稱之為卵巢巧克力囊腫。