如果確診為急性梗阻性化膿性膽管炎，需做急診手術或者介入治療。若由膽管末端結石嵌頓引起，治療需根據每個醫院的治療方法而定，通常是在B超引導下穿刺引流。因為膽管炎出現休克，需要超聲科醫生把B超機推到床邊，在B超引導下穿刺，穿刺本身有出血風險，但一旦確診為急性梗阻性化膿性膽管炎，醫生必須要決斷，跟患者充分的溝通進一步發展的風險，及時治療。此外，可在十二指腸鏡下做ERCP或者EST，把狹窄段打開，取出結石或者結石掉下，解除梗阻，癥狀可緩解，再進行大量的抗休克、抗生素及補液支持治療。若條件不允許，但心肺的功能允許的情況下，必須做急診開腹手術。