急性梗阻性化膿性膽管炎的病程多在膽道梗阻基礎上發生，先發生急性膽管炎的相關改變，如腹痛、黃疸、高熱，在膽道感染的情況下再進一步加重，引起膽汁化膿。膽道梗阻持續存在，膽管內壓力逐步上升，當上升到一定程度時會引起大量膿性膽汁和細菌通過膽血返流到血液，此時大量細菌進入血液，會引起嚴重的全身感染。感染嚴重的情況下會引起感染性休克，血壓下降、心率加快，大量毒性物質進入血液，引起腦部異常，從而形成中樞性抑制，導致昏迷，因此急性梗阻性化膿性膽管炎的病情是逐漸由急性膽管炎梗阻沒有解除，感染進一步加重而發生。因此出現急性梗阻性化膿性膽管炎時，往往會有生命危險。首先在早期要及時針對急性梗阻性化膿性膽管炎進行感染控制、梗阻解除，如果后期出現嚴重的急性梗阻性化膿性膽管炎，需要及時針對膽管減壓引流，才能有效緩解病癥加重。