甲亢藥尤其是抑制甲狀腺素合成的藥，無論是丙基硫氧嘧啶，還是甲巰咪唑，都和服藥的時間關系不大。甲亢藥在飯前吃、飯后吃、飯中吃影響不大，但是所有的藥物，如果口服沒有嚴重胃腸反應，空腹服用吸收會比較好，甲亢藥飯前飯后都可以吃，影響不太大。在甲亢治療方面主張足量足療程，開始得病時建議上足量，然后根據甲狀腺功能、治療時間，逐漸減少藥量。在服用過程中，實際上丙基硫氧嘧啶是一個偏短效的藥，一般要吃3頓，逐漸減成2頓、1頓。而甲巰咪唑相對半衰期比較長，如果在1天吃3次吃足量時，可以分成3次，隨著劑量的減少，逐漸就可以改成1天1次。