巧克力囊腫可影響懷孕。巧克力囊腫屬于子宮內膜異位癥，為臨床常見疾病，主要由于子宮內膜異位至卵巢，逐漸形成囊腫引起。子宮內膜異位至卵巢時，每月也可脫落，但長此以往，囊腫內形成巧克力液狀黏稠液體，因此臨床上稱為巧克力囊腫。子宮內膜異位癥對懷孕具有全方位影響，可影響卵母細胞質量、輸卵管蠕動、輸卵管質地、改變輸卵管性狀，還可能影響盆腔內外環境。卵巢巧克力囊腫可破壞卵巢組織，影響卵巢功能，進而影響懷孕，因此建議子宮內膜異位癥患者盡早受孕。