系統性紅斑狼瘡的發病機制目前尚未完全明確，在現有醫療研究的基礎上，多認為系統性紅斑狼瘡與自身免疫性疾病相關，常由自身免疫性紊亂所致，多數患者具有遺傳易感基因，發病呈家族聚集傾向，尤其好發于育齡期女性。另外，紫外線照射、EB病毒感染、服用抗結核藥物，均可誘發系統性紅斑狼瘡。綜上所述，系統性紅斑狼瘡是遺傳易感基因的基礎上引起的多基因疾病，在機體免疫紊亂、環境、理化因素、日光照射、激素水平異常共同作用下發病。