慢性胃腸炎在醫學上分為慢性胃炎和慢性腸炎，慢性胃炎患者首先要查幽門螺桿菌，假如他有幽門螺桿菌又有慢性胃炎的癥狀，甚至于胃鏡都提示慢性胃炎，那么建議先根治幽門螺桿菌；第二，假如這個患者主要以上腹脹為主，那么可以口服一些促胃腸動力的藥物和促消化的藥物，有部分患者在胃鏡下提示有嚴重的胃炎的情況下，可以口服PPI類的，比如常見有奧美拉唑、蘭索拉唑或者是雷貝拉唑類的藥物，患者也可以口服一些胃黏膜保護劑，比如達喜、瑞巴派特和施維舒類的藥物。慢性腸炎的患者假如出現了腹瀉的癥狀，可以口服思密達這些止瀉的藥物，患者若長期腹脹、大便不成形，實際上可以口服一點益生菌治療。