胃蛋白酶原主要是由胃黏膜主細胞分泌，其它器官以及組織很少表達，所以胃切除以后胃蛋白酶原會降低。胃蛋白酶原是胃蛋白酶前體，當胃內酸堿度pH值達到1.5-5時，胃蛋白酶原會被激活變成胃蛋白酶，而胃蛋白酶可以參與人體食物消化，屬于重要的消化酶。 人體共分泌四種胃蛋白酶原，包括胃蛋白酶原Ⅰ、胃蛋白酶原Ⅱ、組織蛋白酶Ⅰ以及組織蛋白酶D，具有消化功能的胃蛋白酶主要來源于胃蛋白酶原Ⅰ和Ⅱ，而胃蛋白酶原Ⅰ和Ⅱ以及胃蛋白酶原Ⅰ/Ⅱ的比值是體檢中的腫瘤標志物較常見的指標。近年多項研究表明胃蛋白酶原Ⅱ會在其它腫瘤中升高，例如前列腺癌、乳腺癌、卵巢癌、子宮內膜癌、泌尿系統惡性腫瘤等，可能是由于胃蛋白酶原異位分泌所造成。