胃腸道間質瘤不手術通常不可以治愈。外科手術是早期胃腸道間質瘤唯一可能實現治愈的一種方法，不手術一般不可以治愈。對于腫瘤直徑<2cm的胃腸道間質瘤，如果醫生評估危險性比較低，可以考慮定期隨訪觀察，暫不進行手術。但如果危險性比較高，合并高危因素比較多，建議進行外科手術切除。對于晚期的胃腸道間質瘤，無論是否手術都很難治愈，術后有半數以上的患者會出現復發和轉移，并且復發轉移的腫瘤多數生長比較迅速，對放療和化療均不敏感，患者主要是以靶向藥物治療為主。雖然有些患者可以進行二次手術，或反復的手術但是難以提高生存率。對于這部分患者，總體上影響生存期的主要因素是靶向藥物的療效，而不是手術。手術可以減瘤，在晚期的階段手術是非根治性的，主要的目的是損毀、消除潛在繼發性的有耐藥突變的克隆，病灶切除以后可以延遲耐藥發生的時間。但手術是把雙刃劍，會給患者帶來創傷和風險，需要外科醫生，評估手術是否有必要去做，什么時候去做，以及怎么去做，需要MDT(多學科會診)討論來決定。