胃腸道間質瘤是一種介于良性和惡性之間的腫瘤，目前觀點認為沒有絕對的良性，只是發展潛能不同，因此臨床醫生是通過綜合評估腫瘤部位、大小、可否切除，以及是否有遠處轉移等因素，決定是否需要手術。如果胃腸道間質瘤的直徑<2cm，醫生判定危險性很低，不需要立即手術，只需要規律的去隨訪觀察。如果危險性很高，需要采取手術干預。對于原發局限沒有擴散可切除的胃腸道間質瘤，也要采取手術治療。對于≥2cm的胃腸道間質瘤，需要手術切除，術后還需要根據危險度分級決定是否需要接受靶向治療。通常醫生根據胃腸道間質瘤的大小、核分裂象計數、胃腸道間質瘤原發位置，判定胃腸道間質瘤的復發風險，主要分為極低危、低危、中危和高危四個風險等級。對于中危和高危等級的胃腸道間質瘤，復發風險較大，手術后還需要配合靶向的藥物治療，具體情況會根據臨床情況作為具體指導。