長期胃酸過多會導引起胃黏膜腐蝕性損傷，比如胃鏡下淺表性胃炎、糜爛性胃炎或者胃酸增多導致黏膜下層損傷，導致消化道潰瘍。如果未加以控制，潰瘍會加重，影響血管，導致胃出血，再加重導致黏膜下深層損傷，引起消化道穿孔。 胃酸過多不控制會導致嚴重相關并發癥，如腹痛、消化道出血，胃酸過多向腸道轉移可引起相關腸消化不良的癥狀。長期胃酸分泌過多如果控制不良或者長期應用抑酸藥物，會引起胃黏膜向腸黏膜轉化。