脫氧核糖核酸DNA的序列測定，一般是為了明確病毒是否變異，是否出現了耐藥，一般可以采取全基因組的序列測定，也可以采取某一段的序列測定。全基因組的序列測定，既可以明確已知的變異位點，也可以發現未知的變異位點。對于某一段的序列測定，一般是針對已知的幾個耐藥位點進行測序。臨床上應用較多的是乙肝病毒的DNA序列測定，通常用于判斷病毒是否出現了耐藥，是否出現了變異。一般情況下，如果經過了抗病毒治療，乙肝病毒DNA沒有陰轉，治療效果不好，這時就需要判斷是否病毒出現了變異，對于應用的抗病毒藥物出現了耐藥，所以出現效果不好，這時需要進行DNA的序列測定。另外一種情況，在抗病毒治療過程中，如果開始抗病毒效果非常好，HBV-DNA已經陰轉，但沒有停用治療的藥物，在治療過程中，乙肝病毒HBV-DNA再次出現陽性，這種情況下，要懷疑抗病毒藥是否出現了耐藥，病毒是否出現了變異，這時也需要進行HBV-DNA的序列測定。