由于不同的人群，對于不同藥物的反應性存在著差異，也不排除極少數患者在服用乳酸桿菌后，出現便秘加重的情況。乳酸菌在臨床上是常用的腸道益生菌，通過直接補充可以改善腸道菌群，恢復正常腸道菌群構成，對腸道功能起到調節作用。因此在臨床上廣泛地應用于腹瀉、便秘或腹脹、消化不良這些消化道癥狀的對癥治療。在服用了含有乳酸菌制劑的腸道益生菌藥物后，患者大便會出現改善，如原來腹瀉的患者，在調整腸道菌群后腹瀉緩解，大便性狀趨于正常。便秘患者服用后，可以起到刺激腸蠕動的作用。因此患者的排便也有明顯好轉，排便困難或便塊干硬的癥狀得到緩解。