人體缺碘最主要的危害是容易導致甲狀腺功能下降，因為碘元素是甲狀腺素合成非常重要的原料，如果人體缺碘，就會使甲狀腺素合成原料缺乏，進而會引起甲狀腺分泌的甲狀腺激素數量減少，而引起甲狀腺功能下降的表現，比如容易出現代謝紊亂，使得吃進來的食物不能夠運化，使得人體發生營養不良的風險增加。因為缺碘導致甲狀腺功能下降，也會使得身體抵抗力下降，畢竟因為代謝調節能力變差，為免疫物質提供原料的能力下降，就容易得感染性疾病或者其他疾病，表現為抵抗力下降、身體素質變差。人體缺碘導致甲狀腺功能下降，還容易使人的精神產生一定的抑制，往往會表現出精神淡漠，使得人們的工作、學習能力下降。