根尖囊腫的形成原因為慢性根尖炎長期未接受系統的根管治療，長期刺激牙根尖部最終形成囊腫。囊腫由囊壁包裹。根尖囊腫如不接受治療無法自愈，牙根尖周圍軟組織和硬組織會受到破壞，甚至影響鄰近牙齒的牙根尖，導致牙齒根尖出現吸收，或出現牙槽骨、頜骨的空腔，形成瘺道，使得根尖膿包經久不愈，可引起急性癥狀發作。因此當患者出現根尖囊腫時，應及時到醫院接受診治。