牙齒根尖囊腫的治療，一般首選根管治療。因為根尖囊腫也是屬于根尖周炎的一類疾病，根尖周炎可能表現為根尖囊腫、根尖肉芽腫及根尖膿腫，都屬于根尖周炎的范疇。對于根尖周炎，如果進行根管治療，可以將根尖周圍的炎癥以及牙髓的壞死組織、炎癥組織以及牙周的炎癥，得以較理想和較完善地控制和去除。因此對于牙齒的根尖囊腫，首選根管治療進行治療，其效果肯定較好。因為根管治療，首先要將牙髓進行開髓引流，將根管內的炎癥組織盡量釋放。其次再進行根管的預備，將根管內的炎癥組織、壞死組織等進行徹底清創。再進行根管的消毒、充填，從而徹底將根尖炎癥控制住，就可以將根尖囊腫治療完善。