凌晨咳嗽很有可能是患了咳嗽變異性哮喘，咳嗽變異性哮喘咳嗽的特點就是在凌晨和夜間發作明顯，而且咳嗽為陣發性、干咳，還會被誘發因素所誘發，例如吸入冷空氣、煙味、灰塵、花粉、呼吸道感染等。咳嗽變異性哮喘是一種特殊類型的哮喘，以咳嗽為唯一表現或主要表現的哮喘，氣道炎癥的形式與哮喘相同，治療也與哮喘相同，推薦應用吸入糖皮質激素進行治療，并且推薦吸入糖皮質激素聯合長效β2受體激動劑的聯合制劑進行治療，例如布地奈德、福莫特羅、氟替卡松、沙美特羅等。因為有研究表明，聯合制劑比單藥吸入糖皮質激素，對咳嗽變異性哮喘癥狀的改善會更好。另外，白三烯受體拮抗劑如孟魯司特，對于咳嗽變異性哮喘的治療也有效，對于激素治療效果不好的咳嗽變異性哮喘，白三烯受體拮抗劑可能有效。