小腿肚疼的原因有以下幾方面：1、生理性因素：如果前1天跑步或進行劇烈鍛煉，第2天早晨小腿肚子可能會出現疼痛，是由于局部乳酸堆積，刺激小腿肌肉引起，屬于生理性表現，多喝水并適當按摩、休息能夠緩解；2、病理性因素：如果小腿肚子感覺脹，甚至出現酸、麻、疼痛，通常由于腰椎間盤突出引起，由于小腿，尤其小腿后外側，神經來自于腰椎，如果出現腰椎間盤突出，壓迫坐骨神經表現為小腿肚子疼痛，甚至伴有麻木，出現放射樣、牽扯樣不適，需要進行腰椎間盤治療。患者可就診于看脊柱外科，由脊柱外科醫生判斷是否存在腰椎間盤突出，需要進行腰椎CT或核磁共振檢查。