生物鐘紊亂導致失眠需先針對引起生物鐘紊亂的原因進行治療，如果經常熬夜，夜間12點以后睡覺而造成的生物鐘紊亂。這類情況可調整睡眠時間，需在10：00-10：30上床睡覺，睡前不要看電視、電腦、手機，通過調整睡眠周期保持8小時睡眠，6：00-7：00起床。如果難以入睡，可用藥物改善睡眠，通過一段時間調整，可以改善因為生物鐘紊亂而造成的睡眠障礙。部分患者是因為經常上夜班，出現晝夜顛倒的生物鐘紊亂，這類情況可能需要通過一段時間進行調整。通常提倡使用藥物調整睡眠的周期，夜間需在固定時間睡覺，通過固定的時間睡覺和起床可改善這類癥狀，也可用藥物進行輔助治療，也可用食物，如牛奶、蜂蜜 、水或者改善習慣進行輔助，如泡腳、洗熱水澡以及睡覺時保持環境的黑暗和安靜，從而可以促進大腦褪黑素分泌，改善生物鐘紊亂。若有部分患者是因為時差關系造成，若到當地是白天，盡量不要睡覺，到相應時間后睡覺。回來后如果是白天，也盡量不要睡覺，到夜間10點左右再上床睡覺。若難以入睡，也可用藥物調整生物鐘，從而改善癥狀。