復雜性肛瘺的治療現在比較科學的方法，盡量損傷小，保護肛門功能，復雜性肛瘺有一個內口有多個外口，有低位復雜性肛瘺，還有高位復雜性肛瘺，像低位復雜性肛瘺，把竇道多個外口都應該切開，能縫合的縫合，能留橋的留橋，對口引流，還有的可以掛線，像高位復雜性肛瘺，低位部分就是復雜性，低位部分有切開、掛線，高位的地方一定要掛線，因為高位的地方怕損傷到括約肌，括約肌損傷之后容易引起肛門畸形、肛門失禁，所以復雜性肛瘺治起來應該是很復雜的過程，怎樣能保護肛門的功能，損傷小、愈合快，就怎么治療，治療的越好。