嬰兒可以吃低聚果糖，但低聚果糖在天然的營養成分中即含有，對于嬰兒的腸道的調節有幫助，比如部分嬰兒出現便秘，可以在醫生或營養師的指導下，適當的食用低聚果糖。低聚果糖本身是合生元，即益生菌中的成分，對腸道菌群和消化功能的調節有幫助。但不建議嬰兒在沒有任何疾病的情況下，單獨去補充低聚果糖，平時可以通過食物攝入。通過母乳喂養或者已經開始輔食添加的嬰兒，需要多吃膳食纖維豐富的食物，其中含有低聚果糖，對腸道菌群的調節有幫助。