卵巢巧克力囊腫會影響懷孕。卵巢巧克力囊腫學名也叫卵巢子宮內膜異位囊腫，其成因是在子宮內膜，應該是長在子宮腔里面。如果異位到卵巢，隨著來月經就會出血，出血以后周圍形成纖維素包裹。然后里面有些成分會被吸收，剩下陳舊性的血形成如巧克力色的，一種稠厚的、包裹的內容物，因此叫做巧克力囊腫。其本身因為周圍包裹、粘連，可以因機械性導致輸卵管扭曲，也形成輸卵管不通而導致不孕。此外，還有可能因為本身內環境的問題，會干擾懷孕。即使在輸卵管通的情況下，懷孕的幾率也要比正常人低。另外，這種人如果為其進行促排卵治療，或者是住院治療，相對來說其成功幾率也相對偏低。因此，整體這個病會影響受孕。如果有比較大的巧克力囊腫，建議先做手術切除，不僅是切除囊腫，可能也需要改善盆腔的狀況，這時受孕的幾率會高很多。