跑步后膝蓋疼痛主要是由于髕骨軟化癥，或者由于膝骨關節炎造成，少數情況下是由于半月板的損傷造成。具體處理方法如下：1、注意在跑步時應避免超出身體負荷，不要長距離跑步，也不要在寒冷的環境下跑步，可以避免膝關節受涼，也能保護關節軟骨；2、一定要根據自身情況選擇合適的運動量，每天進行熱敷理療，促進局部的血液循環，從而降低炎癥因子，減輕膝關節的疼痛。每天用熱水袋熱敷15分鐘左右，有利于性關節疼痛的緩解，避免腫脹；3、多做免負重的功能訓練，或進行肢體抬高訓練，或是進行空中自行車，或者是騎車、游泳等，都有助于提高膝關節周圍肌肉韌帶的強度，從更好的保護關節；4、如果疼痛比較明顯，可以適當口服氨基葡萄糖，或者非甾體類抗炎藥物，如布洛芬、雙氯芬酸鈉、洛索洛芬鈉等。根據自身的胃腸道功能，選擇一種藥物口服。通過多種方法，才能使膝關節的疼痛逐漸緩解，降低自身的體重，注意保暖，才能使關節軟骨得到保護，使膝關節功更長久的使用。