早上不吃早飯對消化系統傷害主要集中在這兩個部位，即胃和膽囊。每天凌晨的時候胃中會有大量新生的質子泵分泌胃酸，泌酸小管基本單位就在凌晨進行大量更新，因為質子泵更新，再加上一些激素導致胃酸很多。如果食物不能將它中和，胃病的發生率會比較高，可產生各種各樣的疾病。 因為食物在胃中可以形成保護，早上不吃早飯會導致空腹時間過長，膽囊不將膽汁排出。可導致膽汁淤積時間過長，滋生和繼發膽囊結石，小結石一點點的變成大結石，需要手術來解決。