碘缺乏對于機體造成的最大危害就是甲狀腺激素合成、分泌減少，造成甲狀腺功能減退癥。碘缺乏多見于解放前，由于在山區食物中含有的碘較少。而碘是合成甲狀腺激素的原料，機體內的碘絕大多數都是在甲狀腺上皮細胞內聚集，甲狀腺上皮細胞經過碘化酪氨酸合成單碘酪氨酸、雙碘酪氨酸、三碘酪氨酸和四碘酪氨酸，也就是甲狀腺激素。如果沒有碘，機體內就不能合成甲狀腺激素，而甲狀腺激素是維持人體代謝的興奮性激素。當此激素不能合成，機體就缺乏甲狀腺激素，產生低代謝癥候群，患者可以出現記憶力減退、嗜睡、關節疼痛、體重增加、黏液性水腫。黏液性水腫是一種特殊的水腫，皮膚表面光亮，壓之無洼陷感。累及到心臟的時候，可以導致心音低鈍、心律慢、心包積液。重癥患者還可以發生黏液性水腫昏迷，是非常危險的情況。碘缺乏的女性患者可以出現月經紊亂，以月經量增多為其表現。有的患者還可造成不孕不育癥，或者導致肝臟功能受損，發生甲減性肝損傷。因此需要給予左甲狀腺激素替代治療，上述癥狀可以逐漸消失。